週間カンファレンスとして、入院患者に携わる医局員が参加する教授回診、手術内容のプレゼンテーション、放射線治療カンファレンス、症例検討を行い、医局員全員が参加する医局会、抄読会、予演会を行っています。また月1回、研究に携わる医局員が参加する大学院生の研究検討会を行っています。他にも、関連病院の医局員を対象とする症例検討会や、県内すべての耳鼻咽喉科・頭頸部外科医を対象とする講演会・セミナーなども定期的に開催しています。
週間カンファレンス
| 火曜 （午後） | 教授回診、手術内容のプレゼンテーション、 症例検討（手術症例、腫瘍症例、難治症例など） 医局会、英語論文の抄読会、学会発表の予演会など 大学院生の研究検討会（月1回） |
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| 木曜 （午後） | 放射線治療カンファレンス（放射線科と合同）、症例検討（手術症例、腫瘍症例、難治症例など） |
症例検討会（3か月ごと）
滋賀医科大学耳鼻咽喉科・頭頸部外科の医局員、関連病院の医師を対象とし、難治症例の検討や研修、研鑽、専門的な医療知識や技術等に関する支援などを行い、あわせて関連病院間での連携を深めるなど交流している。
講演会・セミナー（年間4－5回）
県内のすべての耳鼻咽喉科・頭頸部外科医を対象とし、各領域のスペシャリストを招聘して、講演会やセミナーを開催している。
